Инструментальное средство поиска регуляторных мотивов в геномах - диплом по программному обеспечению, программированию

 

Тезисы:

  • Алгоритм применяли для поиска регуляторных мотивов в геномах бактерий и некоторых растений.
  • Применение сравнительной геномики к поиску регуляторных модулей.
  • Клифтен и др. [80] использовали филогенетический футпринтинг для поиска мотивов в шести геномах.
  • Построить схемы скрытых марковских моделей (СММ) для поиска мотивов с более сложной структурой.
  • Алгоритмы, использующие различные наборы последовательностей для поиска в них мотивов.
  • Ван Хельден и др. [40] разработали алгоритм поиска мотивов, названный Oligo-Analysis.
  • Алгоритм MEME [55] , созданный Бейли и Элканом, применяет стратегию EM для поиска мотивов.
  • В алгоритме MEME используются три новаторские идеи для поиска мотивов.
  • При этом они используют различные методы поиска мотивов, в том числе и филогенетический футпринтинг.
  • Далее с помощью полученных PWM мотивы ищутся перед всеми генами каждого генома.

 

 

Похожие работы:

Предметы

Все предметы »

 

 

Актуальные дипломы по программному обеспечению, программированию